t-PA K1区的同源模建及Kringle区与Lysine相互作用的研究

摘要:

利用同源模建方法预测了t-PA K1区的三维结构。通过结构叠合确定了t-PA K1、K2区，纤溶酶原K1、K4区及UK K区的Lysine结合口袋。静电势计算及疏水性分析表明，在t-PA K2区以及纤溶酶原K1、K4区与纤维蛋白裸露的Lysine之间存在明显的静电势互补和疏水面契合。确定了影响Kringle区结合口袋与Lysine亲和的重要氨基酸，分析了t-PA K1区、UK K区不能结合Lysine的原因，由此设计了具有Lysine亲和力的新型t-PA K1区及UK K区突变体。利用模拟残基突变技术预测了突变体的结构变化，分析了突变后t-PA K1区及UK K区与Lysine亲和力的变化，初步在理论上肯定了设计方案的合理性。

关键词:同源模建，结构功能关系的计算机模拟，分子设计，Kringle区

Abstract:

Key words:同源模建，结构功能关系的计算机模拟，分子设计，Kringle区