《生物工程学报》（Chinese Journal of Biotechnology）是由中国科学院微生物研究所和中国微生物学会主办、 国内外公开发行的综合性学术期刊。1985年创刊，现为月刊。《生物工程学报》已被美国化学文摘CA、美国生物学文摘BA、美国医学索引IM/MEDLINE、俄罗斯文摘AJ、日本科学技术社数据库JST、英国国际农业与生物科学研究文摘CABI、美国剑桥科学文摘（自然科学卷）CSA(NS)、波兰哥白尼索引IC、荷兰Elsevier的Scopus、荷兰医学文摘EMBASE、中国科学引文数据库、万方数据库及中国电子期刊光盘版等检索系统收录，是北大中文核心期刊、中国科技核心期刊、CSCD核心期刊和中国科技期刊卓越行动计划入选期刊。

      《生物工程学报》主要报道动物、植物、微生物以及医学等生物工程相关领域的新发展、新成果、新技术，以及高校生物学教学研究改革等，主要栏目有：综述、动物及兽医生物技术、海洋生物技术、合成生物技术、环境生物技术、工业生物技术、农业生物技术、食品生物技术、医药生物技术、组织工程与细胞培养、生物技术与方法、生物育种与工艺优化、科学进展/专家评述/观点、高校生物学教学等。